之后在廖立的帮助之下，关羽利用自己在军政两届的影响，做了一系列的安排。

对着这些安排，诸葛亮一开始并不知道，他认为现在关羽最多也就是跟他闹闹矛盾，自己将来只需向其解释一番，一切问题也不再成为问题。

所以，诸葛亮除了关羽所在的巴郡之外，在南方的三郡都调整了人事的任命，依旧是任命董和为犍为太守，伊籍为汉嘉太守，尹默为江阳太守，让原本身为建宁太守的孟获担任督邮，而不再遥领建宁太守之职，又以孟获之兄孟节为从事中郎，弟孟优为偏将军，以便安抚孟获，好在孟获由于对诸葛亮七擒七纵很服气，现在是带着部众前往成都投靠，对于诸葛亮的安排倒也没有说什么，只是其妻祝融及弟孟优对此有些不满，私下说着要收复故地，却被孟获喝斥住。

与此同时，诸葛亮还与秦宓长谈许久，做好了只要与关羽沟通成功，立刻派秦宓前往江东找孙权和谈的打算。

为此诸葛亮还专门给关羽写了一封信，在信中详细的说明了他这样做的目的、可行性以及今后的打算，然而关羽看完之后却并没有回复一个字。

随后不久，诸葛亮被各处传来的消息所震动：益州东、南部毗邻孙权领地的那些文职太守全部被关羽率军赶走，然后换成了军中的将领：巴郡太守依旧是关羽兼任，犍为太守被换成了孟获，汉嘉太守是吴懿，江阳太守则是张翼。

孟获本来就对自己被任命为一个文职感到有些不满，只是由于诸葛亮的威望才不得不服从，现在突然被任命为犍为太守，并且遥领建宁都督，心中十分欢喜，高高兴兴的找到诸葛亮，感谢诸葛亮给他这样的职位（他以为自己的职位是诸葛亮任命的），准备上任。

与此同时，关羽大肆的招兵买马，训练士卒，并且命令各地驻守士兵进行屯田，准备长期与孙权的大军对峙，如果不是顾忌孙权所派遣的巴郡太守周瑜火计厉害，而己方的实力又有所不足，估计早就率军发起进攻了。

听闻消息的诸葛亮很是无奈，因为关羽在国内的威望实在是太高，他是从一开始就追随着刘备创业的人物，就连府内那些元老级的内政官员如糜竺、简雍、孙干等人都与他交好，军中将士更是对他钦服，再加上有张飞的支持，自己根本无力与他相抗。

“本来以为主公已经对我绝对的信任，可是没想到竟是这么一副局面，我还是太年轻啊，再加上这一段时间以来，我的建议很难得到主公的采纳，故此我的威望实在是不够，尽管主公已经将世子托孤给我，而且还将内政完全委托给我，我却也无法获得众人的支持，如果上天真的让我掌管蜀国军政外交，我纵然不能保证全复昔日的荣光，也能够保证这份基业在我有生之年不失，可是现在，主公，请恕亮无能，不能为主公继续效力了。”

诸葛亮深思了一晚上，知道自己不能再与关羽继续对立下去了，否则的话一旦蜀军内乱，灭亡的将会更快，只好向刘禅写了一封辞呈，辞去一身的职务，搬到蜀郡乡下隐居去了。